侵华日军南京大屠杀史研究会副会长孙宅巍认为，南京大屠杀前后两个半月内，南京地区人口减少了78.5万。这些减少的人口虽然包括外逃到其他地区的，但南京人口大幅度减少是不争的事实，是证明南京大屠杀的有力佐证。而这些档案出自日本关东军，可以更客观地证明日军侵华时犯下的罪行。当时的日本媒体则报道了大屠杀惨况。1937年12月23号的一份日文报纸《大阪每日新闻.奈良版》，刊登该社随军记者光本的报道《南京总攻击观战记》，报道了侵入南京的日军三天内打死了8.5万人。
赵玉洁：有一个题为叫《南京总攻击观战记》的一份新闻报道，在这个报道当中，反应注明日军助川部队和海军"扫荡"的情况，当时从下关码头最近的一条街到扬子江下游尸体绵延两三里远。
对于日军的暴行，一些日本人也看不下去。1938年3月12号，隶属于日军华中荻洲部队的渡边德右卫门在发给新潟县西颈城郡上早川村关原草苗的信中写道："二月六日我中队在警备中，附近有近万名残余敌人。可怜的是当地的老百姓，因为接到全部杀光的命令，虽然我们对小孩子多少抱有一丝同情，但含着眼泪，一起杀掉的也不少！据了解，目前已经发掘的89件档案只是吉林省馆藏档案的冰山一角，随着翻译、整理工作的继续进行，还会有更多揭露日本侵略罪行的档案被发掘。上海师范大学人文与传播学院院长苏智良表示：
苏智良：可以说非常有价值，因为这些档案主要是关东军的档案，也就是日军自己留下的日文的档案。而且它涉及到很多的方面，简单的说可以说是日本侵略中国的简史。
2005年，日本扶桑社出版的教科书中将"南京大屠杀"称为"南京事件"，对屠杀我同胞一事只字未提。2007年6月19号，由日本执政党自民党中约100名国会议员组成的"思考日本前途与历史教育议员会"声称, "我们无法确认南京大屠杀的事实"。2012年2月，日本名古屋市市长河村隆之在谈及"南京大屠杀"时宣称"没有这回事"。 安倍上台之后，日本右翼的声浪愈发高涨，马年春节期间，日本岛内再次传来令人愤慨的噪音，2月3号，日本NHK经营委员百田尚树在街头演讲中公开声称，不存在南京大屠杀。
2012年，安倍上台之后，在其言行刺激下，日本右翼势力更加活跃，频频爆出损害中日关系的言论，在中国社会科学院研究员蒋立峰看来，这次侵华日军档案的公开，是对安倍内阁漠视历史行径的有力回击。
蒋立峰：安倍说侵略无定义，它实际上就是否认日本在近代史上进行过侵略，为侵略战争翻案，实际上定义是非常明确的，我们怎么样去反驳他呢，我们就要拿这些他们自己侵华日军形成的这些档案，我们给他发掘出来，给他归纳整理出来，而且是全方位的，非常深入的这些东西，我们公诸于世，让安倍看一看，他那种说法就可以说不攻自破。
